Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Trabd2bB1ATG9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Trabd2bB1ATG9 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Trabd2bB1ATG9 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Trabd2bB1ATG9 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Trabd2bB1ATG9 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Trabd2bB1ATG9 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Trabd2bB1ATG9 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Trabd2bB1ATG9 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Trabd2bB1ATG9 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Trabd2bB1ATG9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Trabd2bB1ATG9 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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Trabd2bB1ATG9 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Trabd2bB1ATG9 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Trabd2bB1ATG9 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Trabd2bB1ATG9 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Trabd2bB1ATG9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Trabd2bB1ATG9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Trabd2bB1ATG9 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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