Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Ttll11A4Q9F4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Ttll11A4Q9F4 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms