Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
CtcflA2APF3 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Cd163l1-204ENSMUST00000209637 3210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
CtcflA2APF3 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms