Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GS82

A730009L09Rik, RIKEN cDNA A730009L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 72 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A730009L09RikA0A1B0GS82 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
A730009L09RikA0A1B0GS82 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
A730009L09RikA0A1B0GS82 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
A730009L09RikA0A1B0GS82 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
A730009L09RikA0A1B0GS82 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
A730009L09RikA0A1B0GS82 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
A730009L09RikA0A1B0GS82 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
A730009L09RikA0A1B0GS82 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
A730009L09RikA0A1B0GS82 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
A730009L09RikA0A1B0GS82 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
A730009L09RikA0A1B0GS82 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
A730009L09RikA0A1B0GS82 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
A730009L09RikA0A1B0GS82 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
A730009L09RikA0A1B0GS82 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
A730009L09RikA0A1B0GS82 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
A730009L09RikA0A1B0GS82 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
A730009L09RikA0A1B0GS82 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
A730009L09RikA0A1B0GS82 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
A730009L09RikA0A1B0GS82 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
A730009L09RikA0A1B0GS82 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
A730009L09RikA0A1B0GS82 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
A730009L09RikA0A1B0GS82 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
A730009L09RikA0A1B0GS82 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
A730009L09RikA0A1B0GS82 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
A730009L09RikA0A1B0GS82 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
A730009L09RikA0A1B0GS82 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
A730009L09RikA0A1B0GS82 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
A730009L09RikA0A1B0GS82 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
A730009L09RikA0A1B0GS82 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
A730009L09RikA0A1B0GS82 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
A730009L09RikA0A1B0GS82 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
A730009L09RikA0A1B0GS82 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
A730009L09RikA0A1B0GS82 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
A730009L09RikA0A1B0GS82 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
A730009L09RikA0A1B0GS82 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
A730009L09RikA0A1B0GS82 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
A730009L09RikA0A1B0GS82 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
A730009L09RikA0A1B0GS82 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
A730009L09RikA0A1B0GS82 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
A730009L09RikA0A1B0GS82 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
A730009L09RikA0A1B0GS82 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
A730009L09RikA0A1B0GS82 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
A730009L09RikA0A1B0GS82 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
A730009L09RikA0A1B0GS82 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
A730009L09RikA0A1B0GS82 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
A730009L09RikA0A1B0GS82 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
A730009L09RikA0A1B0GS82 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
A730009L09RikA0A1B0GS82 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
A730009L09RikA0A1B0GS82 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
A730009L09RikA0A1B0GS82 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
A730009L09RikA0A1B0GS82 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
A730009L09RikA0A1B0GS82 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
A730009L09RikA0A1B0GS82 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
A730009L09RikA0A1B0GS82 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
A730009L09RikA0A1B0GS82 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.51□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms