Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 1700041M19Rik-202ENSMUST00000190908 1123 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Speer3W4VSP1 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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