Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2E2

Mbd1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd1Q9Z2E2 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Mbd1Q9Z2E2 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Mbd1Q9Z2E2 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Mbd1Q9Z2E2 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Mbd1Q9Z2E2 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Mbd1Q9Z2E2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Mbd1Q9Z2E2 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Mbd1Q9Z2E2 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Mbd1Q9Z2E2 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Mbd1Q9Z2E2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Mbd1Q9Z2E2 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Mbd1Q9Z2E2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mbd1Q9Z2E2 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Mbd1Q9Z2E2 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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