Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E2

Plod1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod1Q9R0E2 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Plod1Q9R0E2 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Plod1Q9R0E2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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Plod1Q9R0E2 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Plod1Q9R0E2 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Plod1Q9R0E2 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Plod1Q9R0E2 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Plod1Q9R0E2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Plod1Q9R0E2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Plod1Q9R0E2 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Plod1Q9R0E2 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Plod1Q9R0E2 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Plod1Q9R0E2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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