Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gpc6Q9R087 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms