Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ09

Phtf1, Putative homeodomain transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phtf1Q9QZ09 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Phtf1Q9QZ09 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms