Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Pkd2l2Q9JLG4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.2 ms