Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Lsm2-207ENSMUST00000173004 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Habp4Q9JKS5 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms