Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Tuba8Q9JJZ2 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Tuba8Q9JJZ2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Tuba8Q9JJZ2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Tuba8Q9JJZ2 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Tuba8Q9JJZ2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Tuba8Q9JJZ2 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Tuba8Q9JJZ2 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Tuba8Q9JJZ2 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Tuba8Q9JJZ2 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms