Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Clstn2Q9ER65 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Clstn2Q9ER65 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Clstn2Q9ER65 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Clstn2Q9ER65 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Clstn2Q9ER65 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Clstn2Q9ER65 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Clstn2Q9ER65 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Clstn2Q9ER65 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clstn2Q9ER65 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms