Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQJ0

Tpcn1, Two pore calcium channel protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpcn1Q9EQJ0 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tpcn1Q9EQJ0 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms