Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB7

Gpr88, Probable G-protein coupled receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr88Q9EPB7 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Gpr88Q9EPB7 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gpr88Q9EPB7 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gpr88Q9EPB7 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gpr88Q9EPB7 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gpr88Q9EPB7 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gpr88Q9EPB7 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Gpr88Q9EPB7 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gpr88Q9EPB7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gpr88Q9EPB7 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gpr88Q9EPB7 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Gpr88Q9EPB7 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms