Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

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Length 667 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rnf6Q9DBU5 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rnf6Q9DBU5 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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