Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccdc97Q9DBT3 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ccdc97Q9DBT3 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Ccdc97Q9DBT3 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccdc97Q9DBT3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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