Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBE9

Ftsj3, pre-rRNA processing protein FTSJ3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ftsj3Q9DBE9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ftsj3Q9DBE9 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms