Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fundc1Q9DB70 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms