Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Cldn22Q9D7U6 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms