Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Hnf4aos-203ENSMUST00000141329 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Dleu2-205ENSMUST00000182325 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Capns2Q9D7J7 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Capns2Q9D7J7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Capns2Q9D7J7 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Capns2Q9D7J7 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Capns2Q9D7J7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capns2Q9D7J7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capns2Q9D7J7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capns2Q9D7J7 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Capns2Q9D7J7 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capns2Q9D7J7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capns2Q9D7J7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capns2Q9D7J7 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capns2Q9D7J7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capns2Q9D7J7 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capns2Q9D7J7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capns2Q9D7J7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capns2Q9D7J7 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capns2Q9D7J7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capns2Q9D7J7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capns2Q9D7J7 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capns2Q9D7J7 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capns2Q9D7J7 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Capns2Q9D7J7 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capns2Q9D7J7 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Capns2Q9D7J7 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms