Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
PrameQ9D4Z5 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms