Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F1

Ndc80, Kinetochore protein NDC80 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 642 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndc80Q9D0F1 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Ndc80Q9D0F1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ndc80Q9D0F1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ndc80Q9D0F1 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ndc80Q9D0F1 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ndc80Q9D0F1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Ndc80Q9D0F1 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ndc80Q9D0F1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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