Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ykt6Q9CQW1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms