Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK3

Rdm1, RAD52 motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdm1Q9CQK3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rdm1Q9CQK3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.4 ms