Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Atg3Q9CPX6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg3Q9CPX6 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms