Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Gdpd3Q99LY2 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Gdpd3Q99LY2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13□□□□□ -0.33
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Gdpd3Q99LY2 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Gdpd3Q99LY2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
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Gdpd3Q99LY2 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
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Gdpd3Q99LY2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gdpd3Q99LY2 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms