Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
TrabdQ99JY4 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms