Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

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Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lims1Q99JW4 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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