Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Smg8Q8VE18 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
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Smg8Q8VE18 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Smg8Q8VE18 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Smg8Q8VE18 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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