Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD24

Zcchc18, Zinc finger CCHC domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc18Q8VD24 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Zcchc18Q8VD24 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Zcchc18Q8VD24 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Zcchc18Q8VD24 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Zcchc18Q8VD24 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Zcchc18Q8VD24 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms