Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
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Fcho1Q8K285 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fcho1Q8K285 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Fcho1Q8K285 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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