Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Ercc8Q8CFD5 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Ercc8Q8CFD5 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Ercc8Q8CFD5 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Ercc8Q8CFD5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
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Ercc8Q8CFD5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ercc8Q8CFD5 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ercc8Q8CFD5 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Ercc8Q8CFD5 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ercc8Q8CFD5 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Pcdhga8-201ENSMUST00000066149 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ercc8Q8CFD5 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ercc8Q8CFD5 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Ercc8Q8CFD5 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ercc8Q8CFD5 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
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