Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDG3

Vcpip1, Deubiquitinating protein VCIP135, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vcpip1Q8CDG3 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vcpip1Q8CDG3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms