Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD92

Ttc27, Tetratricopeptide repeat protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc27Q8CD92 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ttc27Q8CD92 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ttc27Q8CD92 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms