Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9W1

A430089I19Rik, RIKEN cDNA A430089I19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A430089I19RikQ8C9W1 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
A430089I19RikQ8C9W1 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms