Protein–RNA interactions for Protein: Q8C503

Sit1, Signaling threshold-regulating transmembrane adapter 1, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sit1Q8C503 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sit1Q8C503 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sit1Q8C503 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sit1Q8C503 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sit1Q8C503 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sit1Q8C503 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sit1Q8C503 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sit1Q8C503 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Sit1Q8C503 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sit1Q8C503 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sit1Q8C503 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sit1Q8C503 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sit1Q8C503 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sit1Q8C503 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sit1Q8C503 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sit1Q8C503 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sit1Q8C503 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sit1Q8C503 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sit1Q8C503 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sit1Q8C503 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sit1Q8C503 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sit1Q8C503 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Sit1Q8C503 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sit1Q8C503 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
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