Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVA4

Lmod1, Leiomodin-1, mousemouse

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod1Q8BVA4 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Lmod1Q8BVA4 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmod1Q8BVA4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmod1Q8BVA4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmod1Q8BVA4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmod1Q8BVA4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmod1Q8BVA4 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmod1Q8BVA4 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmod1Q8BVA4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmod1Q8BVA4 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmod1Q8BVA4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmod1Q8BVA4 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmod1Q8BVA4 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmod1Q8BVA4 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmod1Q8BVA4 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmod1Q8BVA4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmod1Q8BVA4 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmod1Q8BVA4 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmod1Q8BVA4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmod1Q8BVA4 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmod1Q8BVA4 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmod1Q8BVA4 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmod1Q8BVA4 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmod1Q8BVA4 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmod1Q8BVA4 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Lmod1Q8BVA4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmod1Q8BVA4 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmod1Q8BVA4 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmod1Q8BVA4 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmod1Q8BVA4 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmod1Q8BVA4 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmod1Q8BVA4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmod1Q8BVA4 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmod1Q8BVA4 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmod1Q8BVA4 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmod1Q8BVA4 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmod1Q8BVA4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmod1Q8BVA4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmod1Q8BVA4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmod1Q8BVA4 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmod1Q8BVA4 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Lmod1Q8BVA4 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms