Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gga3Q8BMI3 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gga3Q8BMI3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms