Protein–RNA interactions for Protein: Q8BII3

D130040H23Rik, RIKEN cDNA D130040H23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130040H23RikQ8BII3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
D130040H23RikQ8BII3 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms