Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8BGC1 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BGC1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BGC1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8BGC1 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8BGC1 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8BGC1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Q8BGC1 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms