Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH2

Phkb, Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PhkbQ7TSH2 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PhkbQ7TSH2 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms