Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
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Atp8b3Q6UQ17 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Atp8b3Q6UQ17 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
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Atp8b3Q6UQ17 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Atp8b3Q6UQ17 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms