Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Usp49Q6P9L4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
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Usp49Q6P9L4 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp49Q6P9L4 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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