Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRT3

Parpbp, PCNA-interacting partner, mousemouse

Predictions only

Length 573 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParpbpQ6IRT3 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
ParpbpQ6IRT3 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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