Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Cntn4Q69Z26 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
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