Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnna3Q65CL1 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnna3Q65CL1 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnna3Q65CL1 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnna3Q65CL1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnna3Q65CL1 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnna3Q65CL1 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnna3Q65CL1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnna3Q65CL1 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnna3Q65CL1 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnna3Q65CL1 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnna3Q65CL1 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnna3Q65CL1 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ctnna3Q65CL1 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctnna3Q65CL1 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms