Protein–RNA interactions for Protein: Q61818

Rai1, Retinoic acid-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai1Q61818 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Rai1Q61818 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms