Protein–RNA interactions for Protein: Q61220

Nell2, Protein kinase C-binding protein NELL2, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nell2Q61220 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nell2Q61220 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms