Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Lamb3Q61087 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms